Yedikule, aslında zindan için değil, Bizans'a misafir gelen kralları ve yabancı sarayların mensuplarını ihtişamlı bir şekilde karşılamak için yapıldı. Altın Kapı'yı bir zafer takı olarak dönemin Bizans İmparatoru Theodosius inşa ettirdi. Theodosiustan sonra tahta geçen oğlu da dört tane yüksek gözlem kulesinden oluşan bir kaleyi kapı ile birleştirdi.
Fatih Sultan Mehmet, yapıya üç kule daha ekledi. Ve artık zindanların adını aldığı "yedi kule" (Genç Osman, Cephanelik, 3. Ahmet, Hazine, Zindan, Top ve Bayrak kuleleri) vardı...
Ayrıca kaleye surlar da ekletildi. Padişah, burada bir garnizon oluşturdu. Böylece Bizans ve Osmanlı uygarlıkları bütünleşmiş oldu.
İstanbul kara tarafı surlarının, Yedikule kesiminde imparatorların zafer alayı başında şehre giriş yaptıkları ana tören kapısının adı 'Altın Kapı'ydı.
Hisar, Osmanlı hazinesinin muhafazası amacıyla kullanılıyordu. Sultan II. Selim döneminde eşyalar saraya taşındı ve hisar, zindan olarak kullanılmaya başlandı. Yabancı suçlular ile Osmanlı devlet adamları buraya hapsedildi. Çandarlı Halil Paşa, Trabzon Rum İmparatoru David Kommenos ve oğulları Kanlı Kuyu'da idam edildi. Ayrıca Osmanlı tarihinin en genç padişahlarından Genç Osman da burada boğuldu. II. Mahmud döneminde zindan olarak kullanılmasından vazgeçildi ve 1856 yılında baruthaneye dönüştürüldü.
1968 yılında, İstanbul Hisarlar Müzesi Müdürlüğü'ne bağlandı. Kültür ve Turizm Bakanlığı'na tahsis edilen tarihi yapı, 2004 yılında Maliye Bakanlığı tarafından geri alındı. Swees Turkish International (STI) İç ve Dış Ticaret Şirketi'nin hisarı kiralamak için hazırladığı proje, Kültür ve Tabiat Varlıklarını Koruma Kurulu'na sunuldu. Kurul, 21 Nisan 2004 tarihli kararında 'özgün dokusuna zarar vermemesi koşuluyla' ve 'kısa süreliğine' hisarın kiralanmasına izin verdi. Maliye Bakanlığı, ''1. derece eski eser'' niteliğindeki bu yapıyı, 30 yıllığına bu özel şirkete kiraladı.
Birçok konsere ev sahipliği yapılan hisarda, alan genişletilmek istenildi ve içerisinde bulunan akasya ağaçları kesildi, taşlar söküldü yerine mıcır döküldü. Bu durum sivil toplum örgütlerini rahatsız etti. Ve Şehristanbul Derneği, devir işleminin iptal edilmesi için İstanbul 1. İdare Mahkemesi'ne başvurdu. 2006 yılında, derneğin başvurusu kabul edildi ve devir kararı oybirliğiyle iptal edildi. Danıştay 13. Dairesi, 24.12.2008 tarih ve 2008/8294 No'lu kararı ile mahkemenin bu kararını onadı.
Bu zaman diliminden sonra ise tarihi yapı kendi haline bırakıldı. Bir zamanlar üzerinde altından heykellerin bulunduğu 'Altın Kapı', şimdi ölüm kalım savaşı veriyor.